A web server for interactive and zoomable Chaos Game Representation images

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抄録

Chaos Game Representation (CGR) is a generalized scale-independent Markov transition table, which is useful for the visualization and comparative study of genomic signature, or for the study of characteristic sequence motifs. However, in order to fully utilize the scale-independent properties of CGR, it should be accessible through scale-independent user interface instead of static images. Here we describe a web server and Perl library for generating zoomable CGR images utilizing Google Maps API, which is also easily searchable for specific motifs. The web server is freely accessible at http://www.g-language.org/wiki/cgr/, and the Perl library as well as the source code is distributed with the G-language Genome Analysis Environment under GNU General Public License.

本文言語English
論文番号1751
ページ(範囲)6
ページ数1
ジャーナルSource Code for Biology and Medicine
4
DOI
出版ステータスPublished - 2009 9 17

ASJC Scopus subject areas

  • 情報システム
  • コンピュータ サイエンスの応用
  • 健康情報学
  • 情報システムおよび情報管理

フィンガープリント

「A web server for interactive and zoomable Chaos Game Representation images」の研究トピックを掘り下げます。これらがまとまってユニークなフィンガープリントを構成します。

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